Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms