Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
R3HDM1Q15032 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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