Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHPRHQ149N8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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