Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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