Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSTA3Q13630 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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