Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL4BQ13620 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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