Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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