Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKD2Q13563 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKD2Q13563 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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