Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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TCIRG1Q13488 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCIRG1Q13488 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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