Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SKP2Q13309 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKP2Q13309 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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