Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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