Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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MKRN3Q13064 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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MKRN3Q13064 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MKRN3Q13064 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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