Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STRN3Q13033 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRN3Q13033 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms