Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK3Q13003 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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