Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTP4A2Q12974 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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