Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL9Q07325 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL9Q07325 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms