Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARDQ03181 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms