Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRF8Q02556 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms