Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNC1Q01954 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNC1Q01954 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms