Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
IRF9Q00978 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms