Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXC5Q00444 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms