Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HBBP68871 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HBBP68871 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HBBP68871 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms