Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX16P57768 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX16P57768 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms