Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMSP52788 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMSP52788 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMSP52788 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMSP52788 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms