Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms