Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CX3CR1P49238 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CX3CR1P49238 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CX3CR1P49238 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms