Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC4A3P48751 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC4A3P48751 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms