Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA4P48169 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms