Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GNPDA1P46926 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms