Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACADSBP45954 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACADSBP45954 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms