Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NR4A2P43354 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NR4A2P43354 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms