Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CRATP43155 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CRATP43155 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRATP43155 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRATP43155 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CRATP43155 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CRATP43155 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRATP43155 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms