Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDIT3P35638 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDIT3P35638 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms