Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJA4P35212 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GJA4P35212 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GJA4P35212 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms