Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GBP1P32455 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms