Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 INTS4-211ENST00000535943 1382 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ACMSD-201ENST00000356140 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 ACMSD-202ENST00000392928 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 EAF1-AS1-205ENST00000595975 892 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL121658.1-201ENST00000608489 712 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD11P31277 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD11P31277 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms