Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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