Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms