Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD247P20963 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD247P20963 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD247P20963 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD247P20963 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms