Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGCP20142 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGCP20142 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGCP20142 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGCP20142 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGCP20142 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGCP20142 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms