Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CXCL2P19875 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CXCL2P19875 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms