Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NR2C1P13056 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms