Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT3P12035 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms