Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DMDP11532 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DMDP11532 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DMDP11532 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DMDP11532 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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