Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2AF1L5P0DN76 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2AF1L5P0DN76 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms