Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms