Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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