Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLK3P07288 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLK3P07288 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLK3P07288 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms