Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EDIL3O43854 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms