Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLGNO14967 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms